Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tdrd12Q9CWU0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms