Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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