Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP8

Pold4, DNA polymerase delta subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold4Q9CWP8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pold4Q9CWP8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms