Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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