Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms