Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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