Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snw1Q9CSN1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snw1Q9CSN1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms