Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ifitm3Q9CQW9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifitm3Q9CQW9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms