Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ykt6Q9CQW1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ykt6Q9CQW1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ykt6Q9CQW1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ykt6Q9CQW1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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