Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gkn2Q9CQS6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gkn2Q9CQS6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gkn2Q9CQS6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gkn2Q9CQS6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gkn2Q9CQS6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gkn2Q9CQS6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gkn2Q9CQS6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gkn2Q9CQS6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gkn2Q9CQS6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms