Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms