Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms