Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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