Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rab5aQ9CQD1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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