Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700129C05RikQ9CQ77 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms