Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp2Q9CQ73 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms