Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpa3Q9CQ71 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms