Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms