Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
StambpQ9CQ26 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
StambpQ9CQ26 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms