Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsmce3Q9CPR8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsmce3Q9CPR8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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