Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rpl17Q9CPR4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl17Q9CPR4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl17Q9CPR4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms