Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Bhlhe41Q99PV5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Bhlhe41Q99PV5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms