Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tsnaxip1Q99P25 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsnaxip1Q99P25 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms