Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ms4a8Q99N10 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ms4a8Q99N10 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms