Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpgs1Q99MS8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms