Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prss29Q99MS4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms