Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms