Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcf2Q99LE6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms