Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lysmd3Q99LE3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms