Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gps1Q99LD4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms