Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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