Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpifQ99KR7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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