Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ciao1Q99KN2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Ciao1Q99KN2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Ciao1Q99KN2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Ciao1Q99KN2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Ciao1Q99KN2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms