Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms