Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmed9Q99KF1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmed9Q99KF1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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