Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp11Q99K46 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms