Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krcc1Q99JT5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krcc1Q99JT5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krcc1Q99JT5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Krcc1Q99JT5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krcc1Q99JT5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms