Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacsin3Q99JB8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacsin3Q99JB8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms