Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk9Q99J95 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms