Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms