Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rnf144aQ925F3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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