Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg2Q925E0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg2Q925E0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms