Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim7Q923T7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms