Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrif1Q923B3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrif1Q923B3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms