Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trim59Q922Y2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms