Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms