Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Odf3Q920N1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Odf3Q920N1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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