Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Afg3l1Q920A7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Afg3l1Q920A7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Afg3l1Q920A7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Afg3l1Q920A7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Afg3l1Q920A7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Afg3l1Q920A7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms