Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smarca5Q91ZW3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smarca5Q91ZW3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms