Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx15Q91WE1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms